Poluarea mediului înconjurător are un efect advers asupra plantelor, în special a celor care au efecte benefice asupra sănătății organismului.
Principalele cauze ale dispariției speciilor de plante și animale sunt: distrugerea habitatelor, exploatarea comercială (colectarea plantelor, vânătoarea și braconajul irațional), daunele produse de speciile aclimatizate și poluarea. Dintre aceste cazuri, distrugerea habitatului reprezintă cea mai mare amenințare la adresa acestor specii.
Menținerea ecosistemelor existente, cum ar fi recifele de corali, pădurile sau mlaștinile, depinde în mare măsură de biodiversitatea lor. Dispariția uneia dintre speciile care alcătuiesc o lanț alimentar poate duce la declinul ecosistemului în cauză. Declinul ireversibil al biodiversității are un impact grav asupra nivelului de trai al populației. Ecosistemele sănătoase asigură alimente, aer curat, apă și sol fertil pentru agricultură. De asemenea, 40% din medicamentele moderne provin din plante și animale.